Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SLC11A2-219ENST00000549625 585 ntTSL 519.07■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NAA20-206ENST00000481837 600 ntTSL 318.92■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-218ENST00000521354 785 ntTSL 218.73■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-211ENST00000547579 581 ntTSL 517.53■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.365e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.275e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.275e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 GTF2IP12-203ENST00000635323 939 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.255e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-209ENST00000439677 736 ntTSL 516.61■□□□□ 0.255e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.25e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.025e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.045e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.225e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-208ENST00000436970 560 ntTSL 512.73□□□□□ -0.375e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-219ENST00000485772 608 ntTSL 512.69□□□□□ -0.385e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-207ENST00000546636 2125 ntTSL 1 (best)10.85□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-208ENST00000518517 584 ntTSL 49.61□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-209ENST00000547198 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-213ENST00000547732 546 ntTSL 49.26□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-219ENST00000521561 570 ntTSL 49.03□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-212ENST00000459966 627 ntTSL 28.88□□□□□ -0.995e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-212ENST00000547688 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-206ENST00000546488 569 ntTSL 48.29□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.085e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.11e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 BANP-213ENST00000466197 640 ntTSL 58.04□□□□□ -1.125e-13■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.152e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.171e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NAA20-205ENST00000480550 1000 ntTSL 57.57□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NAA20-204ENST00000463154 1036 ntTSL 37.33□□□□□ -1.242e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-215ENST00000548193 576 ntTSL 35.7□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.527e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.67e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-224ENST00000550995 551 ntTSL 44.79□□□□□ -1.642e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-210ENST00000519250 585 ntTSL 43.95□□□□□ -1.781e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 EMP2-202ENST00000359543 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.734e-8■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 PCLAF-208ENST00000560234 690 ntTSL 29.75□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC087632.1-210ENST00000635593 668 ntTSL 57.39□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 PCLAF-204ENST00000558043 689 ntTSL 27.36□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC087632.1-208ENST00000635511 920 ntTSL 57.2□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC087632.1-205ENST00000635704 670 ntTSL 36.36□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC087632.1-203ENST00000634318 1033 ntTSL 55.76□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.682e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC087632.1-206ENST00000635605 757 ntTSL 54.47□□□□□ -1.692e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC087632.1-214ENST00000635320 568 ntTSL 43.98□□□□□ -1.772e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.862e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 AC087632.1-207ENST00000634529 372 ntTSL 42.7□□□□□ -1.982e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.247e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.037e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)10.53□□□□□ -0.727e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 RFWD2-202ENST00000367666 2022 ntTSL 26.42□□□□□ -1.387e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 RFWD2-209ENST00000491600 773 ntTSL 54.74□□□□□ -1.657e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 RFWD2-205ENST00000459744 741 ntTSL 33.63□□□□□ -1.837e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 RFWD2-210ENST00000498306 617 ntTSL 53.43□□□□□ -1.867e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 PRKRIP1-205ENST00000477886 986 ntTSL 1 (best)23.78■■□□□ 1.48e-9■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.447e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 222.25■■□□□ 1.157e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EXOC3L4-206ENST00000560304 657 ntTSL 321.08■□□□□ 0.977e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 517.84■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EXOC3L4-204ENST00000559693 813 ntTSL 317.35■□□□□ 0.377e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 SPTBN2-202ENST00000527010 859 ntTSL 215.34■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.374e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.89■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 318.8■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NUCB1-209ENST00000465524 839 ntTSL 515.67■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 315.03■□□□□ -02e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 WWC2-207ENST00000508614 604 ntTSL 317.42■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 ACAA1-218ENST00000489559 579 ntTSL 422.18■■□□□ 1.142e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.346e-16■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.649e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 223.65■■□□□ 1.389e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.189e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.129e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.043e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.677e-11■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.629e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.483e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-220ENST00000559930 678 ntTSL 418.01■□□□□ 0.479e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.459e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.333e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NSD1-210ENST00000510954 533 ntTSL 216.72■□□□□ 0.273e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.429e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.429e-8■■■■□ 23.5
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