Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB40BQ12829 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB40BQ12829 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB40BQ12829 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB40BQ12829 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB40BQ12829 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB40BQ12829 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB40BQ12829 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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RAB40BQ12829 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB40BQ12829 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB40BQ12829 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB40BQ12829 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RAB40BQ12829 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RAB40BQ12829 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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RAB40BQ12829 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RAB40BQ12829 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RAB40BQ12829 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB40BQ12829 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB40BQ12829 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB40BQ12829 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB40BQ12829 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB40BQ12829 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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