Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFEMP1Q12805 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFEMP1Q12805 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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