Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 KAP114YGL241W 3015 nt4.53□□□□□ -1.68
AVL9Q12500 HMS1YOR032C 1305 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 LYS5YGL154C 819 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YIL165CYIL165C 360 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 CYC1YJR048W 330 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 CPR3YML078W 549 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YMR084WYMR084W 789 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 TIF34YMR146C 1044 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 URE2YNL229C 1065 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YNR042WYNR042W 429 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 RRP40YOL142W 723 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 snR19snR19 568 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 MNN1YER001W 2289 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 PUT2YHR037W 1728 nt4.52□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 AVT1YJR001W 1809 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SLM5YCR024C 1479 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SDT1YGL224C 843 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 BMT5YIL096C 1011 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 IRC14YOR135C 342 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YPR174CYPR174C 666 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SHE3YBR130C 1278 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 REI1YBR267W 1182 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SUL2YLR092W 2682 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 MMT1YMR177W 1533 nt4.51□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 TFA1YKL028W 1449 nt4.5□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.5□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 DCV1YFR012W 609 nt4.5□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 CCS1YMR038C 750 nt4.5□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 RGS2YOR107W 930 nt4.5□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 ENT1YDL161W 1365 nt4.5□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SSA2YLL024C 1920 nt4.5□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SOF1YLL011W 1470 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SSB1YDL229W 1842 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YDR274CYDR274C 372 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YMR010WYMR010W 1218 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SPO20YMR017W 1194 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 GPB1YOR371C 2694 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 CDC15YAR019C 2925 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 ALG11YNL048W 1647 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 HSP82YPL240C 2130 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YMR1YJR110W 2067 nt4.49□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 OSH2YDL019C 3852 nt4.48□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YMR221CYMR221C 1515 nt4.48□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YCR050CYCR050C 309 nt4.48□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SPR6YER115C 576 nt4.48□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SAE3YHR079C-A 276 nt4.48□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 LSM12YHR121W 564 nt4.48□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 RAD10YML095C 633 nt4.48□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 TIF4632YGL049C 2745 nt4.48□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 VBA2YBR293W 1425 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YEH2YLR020C 1617 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 MDM38YOL027C 1722 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 NKP2YLR315W 462 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 CDC73YLR418C 1182 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 ERD2YBL040C 660 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 AIM39YOL053W 1188 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 MED7YOL135C 669 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 VPS21YOR089C 633 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SUA7YPR086W 1038 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 CNS1YBR155W 1158 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YPL260WYPL260W 1656 nt4.47□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 CLB5YPR120C 1308 nt4.46□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 FMP30YPL103C 1407 nt4.46□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YIL001WYIL001W 1542 nt4.46□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 SSH4YKL124W 1740 nt4.46□□□□□ -1.69
AVL9Q12500 YDR056CYDR056C 618 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 LPP1YDR503C 825 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 POP6YGR030C 477 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 SRB5YGR104C 924 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 RPP0YLR340W 939 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 RCL1YOL010W 1104 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 SET6YPL165C 1122 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 OM14YBR230C 405 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 GLN4YOR168W 2430 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 CDC9YDL164C 2268 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 SRO9YCL037C 1305 nt4.46□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 MET12YPL023C 1974 nt4.45□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.45□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 LOH1YJL038C 660 nt4.45□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 KTR2YKR061W 1278 nt4.45□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 TFA2YKR062W 987 nt4.45□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 SPS19YNL202W 879 nt4.45□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 MRPL37YBR268W 318 nt4.45□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 RAD52YML032C 1416 nt4.45□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 IOC4YMR044W 1428 nt4.45□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 SAF1YBR280C 1914 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 TRM44YPL030W 1704 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 MSS2YDL107W 1056 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 BUD13YGL174W 801 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 ADH4YGL256W 1149 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 YAR030CYAR030C 342 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 DCS2YOR173W 1062 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 YPL278CYPL278C 303 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 NCE102YPR149W 522 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 POP4YBR257W 840 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 OLE1YGL055W 1533 nt4.44□□□□□ -1.7
AVL9Q12500 SAT4YCR008W 1812 nt4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms