Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1B1Q10567 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP1B1Q10567 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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