Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CGNL1Q0VF96 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CGNL1Q0VF96 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms