Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBL2Q08999 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL2Q08999 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms