Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4DQ08499 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4DQ08499 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms