Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 SCS2YER120W 735 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 SPO11YHL022C 1197 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YKL023WYKL023W 834 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 MRPL13YKR006C 795 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YLR156WYLR156W 345 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YLR159WYLR159W 345 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YLR161WYLR161W 345 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 TRM10YOL093W 882 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YOR114WYOR114W 885 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 TRS33YOR115C 807 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 RPB8YOR224C 441 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 PRO2YOR323C 1371 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YGL036WYGL036W 2730 nt5□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YMR102CYMR102C 2505 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 RSC30YHR056C 2652 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 snR7-LsnR7-L 214 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YKL177WYKL177W 339 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YAL069WYAL069W 315 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 SHE1YBL031W 1017 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 FYV6YNL133C 522 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 CYC2YOR037W 1101 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 HIS4YCL030C 2400 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 NOB1YOR056C 1380 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 TDA7YNL176C 1911 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 ARP2YDL029W 1176 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 SCM3YDL139C 672 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 HIS6YIL020C 786 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 RPC25YKL144C 639 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 USB1YLR132C 873 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 GSP1YLR293C 660 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 MRP21YBL090W 534 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 MAP2YBL091C 1266 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 MNT2YGL257C 1677 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 FRS1YLR060W 1788 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 FAA3YIL009W 2085 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 FAP1YNL023C 2898 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 HUL4YJR036C 2679 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 UGA2YBR006W 1494 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 DAS2YDR020C 699 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 RRP45YDR280W 918 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 YEA4YEL004W 1029 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 KXD1YGL079W 657 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 UPS2YLR168C 693 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 VPS21YOR089C 633 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 GRX5YPL059W 453 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 LDH1YBR204C 1128 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 MSC7YHR039C 1935 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS3Q08438 CRT10YOL063C 2874 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 FZO1YBR179C 2568 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 LAP3YNL239W 1365 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 MHR1YDR296W 681 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 FRA2YGL220W 363 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 EST3YIL009C-A 546 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 SDS3YIL084C 984 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 ELO3YLR372W 1038 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 ERD2YBL040C 660 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 CSL4YNL232W 879 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 YPL114WYPL114W 420 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 YPR071WYPR071W 636 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 NPL4YBR170C 1743 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 JEM1YJL073W 1938 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 CAF4YKR036C 1932 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 CLF1YLR117C 2064 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 KIN28YDL108W 921 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 RDI1YDL135C 609 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 HTD2YHR067W 843 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 SOL3YHR163W 750 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 CCS1YMR038C 750 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 UFE1YOR075W 1041 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 NHP6AYPR052C 282 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 RPS9BYBR189W 588 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 IMA3YIL172C 1770 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 IMA4YJL221C 1770 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 GPR1YDL035C 2886 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 CPS1YJL172W 1731 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 MMT2YPL224C 1455 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 TRE1YPL176C 2352 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 YGR125WYGR125W 3111 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 YDR134CYDR134C 411 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 YGL230CYGL230C 444 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 YGR153WYGR153W 654 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 RFA3YJL173C 369 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 YKR070WYKR070W 1059 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 JLP1YLL057C 1239 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 PLP2YOR281C 861 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 ARA1YBR149W 1035 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 SPP381YBR152W 876 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 PUT1YLR142W 1431 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 SEG2YKL105C 3399 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 APM3YBR288C 1452 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 MLC1YGL106W 450 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 PUS6YGR169C 1215 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 BOS1YLR078C 735 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 SEC72YLR292C 582 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS3Q08438 RIF2YLR453C 1188 nt4.93□□□□□ -1.62
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