Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN3Q08043 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN3Q08043 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms