Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC9Q06265 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms