Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDSRQ06136 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms