Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CALD1Q05682 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALD1Q05682 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms