Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POU3F1Q03052 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POU3F1Q03052 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms