Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NHLH2Q02577 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLH2Q02577 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms