Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms