Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OC90Q02509 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OC90Q02509 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OC90Q02509 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OC90Q02509 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OC90Q02509 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OC90Q02509 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OC90Q02509 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OC90Q02509 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OC90Q02509 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OC90Q02509 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OC90Q02509 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms