Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSC2Q02487 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms