Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms