Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms