Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA6Q01524 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms