Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSG6Q00889 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSG6Q00889 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms