Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HBBP68871 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBBP68871 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBBP68871 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBBP68871 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBBP68871 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms