Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN2AP68543 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN2AP68543 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms