Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms