Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms