Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC6P62333 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms