Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS23P62266 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS23P62266 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS23P62266 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS23P62266 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS23P62266 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS23P62266 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS23P62266 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS23P62266 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS23P62266 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms