Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CAP62136 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CAP62136 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CAP62136 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CAP62136 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CAP62136 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CAP62136 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CAP62136 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CAP62136 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CAP62136 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CAP62136 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CAP62136 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CAP62136 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CAP62136 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CAP62136 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms