Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS2P61201 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS2P61201 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS2P61201 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS2P61201 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS2P61201 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS2P61201 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS2P61201 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS2P61201 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS2P61201 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS2P61201 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS2P61201 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS2P61201 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS2P61201 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS2P61201 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS2P61201 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS2P61201 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS2P61201 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS2P61201 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS2P61201 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS2P61201 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS2P61201 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS2P61201 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS2P61201 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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