Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2MP61081 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms