Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms