Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN1P60606 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms