Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SESN3P58005 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SESN3P58005 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SESN3P58005 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SESN3P58005 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SESN3P58005 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SESN3P58005 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SESN3P58005 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SESN3P58005 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SESN3P58005 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SESN3P58005 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SESN3P58005 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SESN3P58005 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SESN3P58005 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SESN3P58005 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SESN3P58005 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SESN3P58005 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SESN3P58005 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SESN3P58005 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SESN3P58005 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SESN3P58005 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms