Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms