Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSCP56915 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSCP56915 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSCP56915 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSCP56915 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSCP56915 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSCP56915 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSCP56915 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSCP56915 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSCP56915 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSCP56915 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSCP56915 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSCP56915 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GSCP56915 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GSCP56915 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSCP56915 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSCP56915 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSCP56915 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSCP56915 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSCP56915 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSCP56915 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSCP56915 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSCP56915 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSCP56915 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSCP56915 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSCP56915 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSCP56915 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSCP56915 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSCP56915 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSCP56915 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSCP56915 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSCP56915 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GSCP56915 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSCP56915 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSCP56915 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSCP56915 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSCP56915 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSCP56915 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSCP56915 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSCP56915 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSCP56915 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms