Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT3AP56704 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT3AP56704 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT3AP56704 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT3AP56704 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT3AP56704 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT3AP56704 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WNT3AP56704 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WNT3AP56704 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WNT3AP56704 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms