Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms