Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A3P53794 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms