Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST2P52849 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST2P52849 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST2P52849 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST2P52849 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST2P52849 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST2P52849 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST2P52849 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDST2P52849 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDST2P52849 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST2P52849 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST2P52849 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST2P52849 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST2P52849 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST2P52849 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST2P52849 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST2P52849 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST2P52849 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST2P52849 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST2P52849 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST2P52849 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST2P52849 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST2P52849 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST2P52849 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST2P52849 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST2P52849 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST2P52849 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST2P52849 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST2P52849 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST2P52849 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST2P52849 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST2P52849 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDST2P52849 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDST2P52849 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDST2P52849 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDST2P52849 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST2P52849 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST2P52849 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST2P52849 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST2P52849 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST2P52849 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST2P52849 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST2P52849 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms