Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.885e-8■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 AHSA2-210ENST00000493310 402 ntTSL 219.48■□□□□ 0.711e-16■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 SNRK-205ENST00000462810 1903 ntTSL 219.43■□□□□ 0.75e-8■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 AHSA2-211ENST00000493628 633 ntTSL 39.76□□□□□ -0.851e-16■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 AHSA2-207ENST00000487904 505 ntTSL 37.49□□□□□ -1.211e-16■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.614e-8■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 MAP4K3-204ENST00000429397 689 ntTSL 338.06■■■■□ 3.688e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.188e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.188e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 QKI-210ENST00000537883 1106 ntTSL 314.25□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 QKI-215ENST00000544823 597 ntTSL 24.94□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 NPSR1-AS1-201ENST00000358772 550 ntTSL 1 (best)6.77□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 NPSR1-AS1-204ENST00000431669 369 ntTSL 1 (best)6.28□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 SPATA5-202ENST00000422835 2492 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.415e-8■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 MAGI3-206ENST00000486456 897 ntTSL 531.89■■■□□ 2.72e-6■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 AHRR-210ENST00000514523 563 ntTSL 428.25■■■□□ 2.111e-6■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 AHRR-206ENST00000510400 576 ntTSL 424.87■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.257e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 CD46-217ENST00000493796 408 ntTSL 54.75□□□□□ -1.652e-9■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 FAM169A-206ENST00000514200 751 ntTSL 428.54■■■□□ 2.161e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 FAM169A-205ENST00000513277 803 ntTSL 328.39■■■□□ 2.141e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 FAM169A-204ENST00000510609 5908 ntTSL 1 (best)17.82■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 FAM169A-202ENST00000506954 571 ntTSL 414.7□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 DCAF6-212ENST00000491067 536 ntTSL 36.47□□□□□ -1.379e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 SERPINB6-203ENST00000380524 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 SERPINB6-202ENST00000380520 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 ACTR3-204ENST00000446821 818 ntTSL 325.61■■□□□ 1.696e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.526e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 ACTR3-203ENST00000443297 566 ntTSL 421.71■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 ACTR3-202ENST00000415792 676 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 TTC6-205ENST00000533625 3567 ntTSL 218.83■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 PAPD7-205ENST00000514697 1901 ntTSL 1 (best)24.54■■□□□ 1.524e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 PAPD7-203ENST00000511764 741 ntTSL 213.59□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 29.7
HNRNPMP52272 TPTEP1-201ENST00000383140 971 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 NT5DC1-204ENST00000460749 907 ntTSL 510.28□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.79e-13■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.579e-13■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 331.63■■■□□ 2.659e-13■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.82e-8■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 423.19■■□□□ 1.39e-13■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.722e-8■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.563e-7■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 316.28■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)6.66□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.92e-8■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 ANTXR2-201ENST00000307333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 ANTXR2-205ENST00000449651 2026 ntTSL 211.4□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 29.6
HNRNPMP52272 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-9■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.556e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.656e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)16.76■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 GALK2-208ENST00000559040 471 ntTSL 515.5■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.773e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.696e-8■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 11e-8■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.027e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 ZNF680-205ENST00000476563 769 ntTSL 35.89□□□□□ -1.476e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.696e-7■■■■■ 29.5
HNRNPMP52272 NCOA1-207ENST00000469850 537 ntTSL 527.04■■□□□ 1.924e-8■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.067e-10■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC18.4■□□□□ 0.548e-8■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 HGD-209ENST00000492108 631 ntTSL 210.59□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)19.58■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 511.2□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 29.4
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 205.9 ms