Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK4P51957 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK4P51957 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEK4P51957 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEK4P51957 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEK4P51957 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NEK4P51957 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEK4P51957 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEK4P51957 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK4P51957 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEK4P51957 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK4P51957 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEK4P51957 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEK4P51957 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEK4P51957 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEK4P51957 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEK4P51957 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEK4P51957 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEK4P51957 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEK4P51957 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEK4P51957 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK4P51957 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK4P51957 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NEK4P51957 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK4P51957 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK4P51957 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK4P51957 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK4P51957 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK4P51957 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK4P51957 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK4P51957 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK4P51957 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEK4P51957 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEK4P51957 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NEK4P51957 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEK4P51957 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEK4P51957 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms