Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLCNKBP51801 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCNKBP51801 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms