Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP1P50238 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms