Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPFP49454 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPFP49454 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPFP49454 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPFP49454 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPFP49454 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPFP49454 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPFP49454 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPFP49454 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPFP49454 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPFP49454 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPFP49454 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPFP49454 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPFP49454 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPFP49454 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPFP49454 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPFP49454 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPFP49454 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPFP49454 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPFP49454 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPFP49454 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPFP49454 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPFP49454 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPFP49454 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPFP49454 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPFP49454 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPFP49454 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPFP49454 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPFP49454 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPFP49454 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPFP49454 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPFP49454 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPFP49454 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPFP49454 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPFP49454 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPFP49454 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPFP49454 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPFP49454 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms