Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNTAP49354 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FNTAP49354 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNTAP49354 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNTAP49354 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNTAP49354 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNTAP49354 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNTAP49354 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNTAP49354 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNTAP49354 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNTAP49354 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNTAP49354 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNTAP49354 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNTAP49354 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNTAP49354 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNTAP49354 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNTAP49354 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNTAP49354 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNTAP49354 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNTAP49354 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNTAP49354 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNTAP49354 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNTAP49354 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNTAP49354 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNTAP49354 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNTAP49354 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FNTAP49354 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNTAP49354 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNTAP49354 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTAP49354 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTAP49354 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTAP49354 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTAP49354 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTAP49354 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTAP49354 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms