Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms