Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARCN1P48444 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms