Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSN1S1P47710 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms