Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGIRP43119 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms